合并后清晰度会下降吗？

不会。合并是把页面对象逐页复制进新文档，文本保持矢量、图片保持原分辨率，不做栅格化。不同来源的 PDF 混合合并，各页保留各自质量。

加密的 PDF 能合并吗？

带打开密码（要输密码才能看）的暂不支持；带权限密码（能看不能打印复制）的部分操作受限。先解密或从源系统重新导出无密码版本再合并。

页内内容完整，但原书签指向原文档结构、合并后通常丢弃——按新页码重建更可靠。正文里的内部跳转链接若指向被移动/删除的页面也可能失效。

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